用AI「創造」蛋白質,「分子之心」獲數億元A輪融資 | 36氪正選

文 | 常澤昱

36氪獲悉,AI蛋白質設計平台公司「分子之心」近日完成數億元A輪融資,由謝諾投資、深創投聯合領投,商湯國香資本、久奕投資跟投。本輪融資將用於進一步擴大復合型人才團隊,深入完善AI蛋白質基礎大模型、AI蛋白質優化設計平台MoleculeOS等技術平台,加速AI蛋白質技術的產業落地和商業化進程。

據悉,這已是分子之心在過去兩年多里獲得的第三輪融資。過往投資方包括合成生物學龍頭企業凱賽生物、紅杉中國、百度BV、聯想創投等。

分子之心成立於2022年1月,由知名計算生物學家許錦波創立,團隊成員均來自全球知名科研機構、跨國藥企、AI公司、合成生物學公司,兼具AI生物交叉背景和跨領域產業經驗。公司目前已自研十餘項性能業界領先的AI蛋白質預測、優化、設計算法。

一站式AI蛋白質預測、優化與設計平台MoleculeOS是分子之心的核心技術平台,36氪此前曾針對該平台做過介紹——通過運用AI方法,該平台能夠幫助生物工作者快速發現、改造、甚至從頭設計具備特定功能的蛋白質,加速實驗室成果的產業轉化。目前已被用於多肽、抗體、酶和小蛋白等各類型蛋白質的研究和設計。

借助自研產業級AI蛋白質生成大模型NewOrigin(達爾文),MoleculeOS的能力正在不斷提升。

分子之心推出的一站式AI蛋白質預測、優化與設計平台MoleculeOS;受訪公司供圖分子之心推出的一站式AI蛋白質預測、優化與設計平台MoleculeOS;受訪公司供圖

作為集成序列、結構、功能和進化的產業級AI蛋白質生成大模型,NewOrigin具備高效的、功能驅動的蛋白質生成能力。「可針對產業應用需求在幾小時內、甚至是分鐘級‘定製’具有特定功能的蛋白質」,談及NewOrigin的優勢,分子之心向36氪表示,該大模型具有成功率高、普適性強、使用門檻低的特點,能夠大幅降低濕實驗篩選、驗證的成本,提升蛋白質優化和從頭設計的效率和成功率。

分子之心告訴36氪,NewOrigin已在大分子藥物設計、極端環境下蛋白質穩定性優化、酶活性優化、酶-特定底物對接、蛋白質從頭設計等產業任務中得到應用,亦已在真實的生產體系中獲得驗證。

例如,在與合成生物學龍頭企業凱賽生物聯合進行的一項關鍵蛋白質優化項目上,「相對於野生菌,人工智能設計的一個重要酶蛋白結構使菌種產率提高了5倍。」

此外,在一項蛋白質疫苗設計項目中,分子之心借助NewOrigin同時針對蛋白疫苗的穩定性、表達量等進行多目標優化,經動物實驗初步驗證,疫苗產生中和抗體滴度為已公開專利和相關大型藥企蛋白疫苗的數倍,突破相關疫苗穩定性專利。

「按需定製」之外,針對蛋白質動態結合設計這一業內兼具產業價值與突破難度的問題,分子之心也自研了算法。分子之心向36氪介紹:「目前AlphaFold等算法局限於蛋白質靜態結構預測,全球範圍內尚無公開的成熟方法。我們自研的蛋白動態結合設計算法,能夠有效規避目前主流算法和大模型大量存在的假陽性問題。」

據悉,前述NewOrigin大模型及蛋白動態結合算法等能力正在被逐漸集成至MoleculeOS中。未來,該平台將面向生物經濟領域不同背景、不同需求的用戶,提供API、軟件、解決方案、技術服務等多種形式的蛋白質設計工具和服務,通過搭建基礎設施平台降低AI蛋白質技術的應用門檻。

除了面向產業發展建設AI生物領域的共性技術平台以外,分子之心也在逐步與醫藥、材料、化工、食品、農業等領域的頭部企業達成深度合作,用AI蛋白質技術突破傳統生物方法的局限,設計性能更優的超級酶,並賦能代謝通路設計、工藝優化等生物製造全流程。